慈恩洞窟位于中国浙江省天台山，因山上有五个天然洞窟，西三东二朝向，洞口均为悬崖至顶。朝西的三个联体洞一向为修行人隐修之地，俗称岩庵，公元597年，智者大师的护法伽蓝在此显瑞，方为时人所知；此后，此洞口挂上“伽蓝显瑞”牌匾，洞前坐北向南建有大雄宝殿、与洞口相向建有大悲殿和寮房，曾拥有十亩水田、三十亩旱地、二十五亩山林。1999年9月永慈老法师来此驻锡，经政府批准更名为慈恩寺，并于2001年5月批准扩建，将山下几乎已被石渣填埋了的人工采石古洞纳入了扩建范围。朝东的二个天然洞，因洞下采石在近代已坍塌。

在乡、镇、县三级人大代表八年的不断提案，永慈老法师召回其徒等因缘下，县人大于2000年召开了第一次“黑洞开发研讨会”，后经专题会议等多次会议讨论，于2001年5月、县四套班子讨论决定，要求慈恩寺将人工古洞建成高品质、高档次的“佛教文化胜地”。于是，慈恩寺组织人员勘察、测量、清理，开始了漫长的洞窟生态修复与清理洞渣之路，在清理与修复过程中，又因慈恩寺的天台止观禅修在2013、2014年间开始受世人瞩目，其周边五村也合并为“慈恩村”。于是，随着洞窟清理工作的不断推进，在石渣中已发现了佛头等文物，“慈恩洞窟”因运而生。

据中科院2002年初步考察，该洞窟拥有三项指标世界之最：一、单洞跨径最大，二、双联栱跨径最大，三有佛元素的古洞中面积最大。现又经过二十多年的努力，根据洞窟内部已清理发现的关联情况，慈恩洞窟初步可分为六大洞区，包括横枭洞区、福泽洞区、德性洞区、智慧洞区、长寿洞区和法华洞区。

原打算在洞中将佛教《大藏经》以经变画的艺术方式加以展示，现在看来洞壁面积大大不够，只能展示人间佛教包含人生三根本的“人生四支柱”和横超三世的“和合”与“奉献”等理念，展现人类命运共通的64个特性以及代表性人物及其故事。